奶水牛繁殖力低、世代间隔长，常规育种工作周期长，效率低。在奶牛育种与繁殖研究室岗位专家刘学洪教授主导下，2011年10月22日和11月10日两次到腾冲县采取槟榔江水牛耳样进行水牛基因分析，找出控制槟榔江水牛产奶性状所的基因组合片段，进一步研究基因组合片段图谱与槟榔江水牛产奶量高低的关系，反过来应用槟榔江水牛基因组合片段图谱指导槟榔江水牛的选育，通过对犊牛出生后进行基因组合片段图谱测定，在犊牛阶段即可初步判定该牛的终生产奶量，提前进行选择淘汰，提高育种效率，降低饲养成本。槟榔江水牛应用奶牛的多基因辅助育种，以获得具有我国自主知识产权产奶量高的优质新品种，为我国奶水牛业健康、持续、高效发展提供强有力的技术支撑。

利用DNA分子标记可有效检测和控制种群近交速率，进行亲子鉴定。有效防止因高度近交导致基因丢失，致使品种衰亡。

通过对奶牛基因组合片段图谱的研究，控制奶牛产奶性能的是特定染色体区域的微效多基因群，这些基因群通过单个效应及互作效应控制奶牛产奶性状的遗传，基因的碱基顺序的差异，影响奶牛产奶量的高低。认识和研究这些重要的经济性状基因的定位，必将为奶牛育种和畜牧业生产带来巨大的经济效益和社会效益。